锰是棉株体内叶绿素的组成部分，它以结合态参加光合作用中水的光解，是维持叶绿体结构的主要元素，是棉花体内许多酶的活化剂，能促进种子萌发和幼苗生长。锰的存在，有利于淀粉酶的活动，促进淀粉的分解和糖类转移。棉花施用锰肥能促进增产14.1%。
(1)缺锰症状幼叶先失绿，在叶脉间出现浓绿与淡绿相间的条纹，显示网状脉纹，叶片的中部比叶尖端更为明显。严重缺锰时叶片还出现淡紫色及淡棕色斑点，叶软下披、脆弱易折、发皱、卷曲甚至凋萎，称为“黄斑病”或“灰斑病”。
(2)缺锰原因 pH>7、沙性大、有机质含量低的地块有效锰含量低，雨水过多易淋失。
(3)施锰方法常用锰肥有硫酸锰、氯化锰、氧化锰、锰螯合物及锰矿渣等，叶面喷施、土壤施用均可矫正缺锰。锰盐都溶于水，喷施、土施均可，而氧化锰、锰矿渣只能作土壤施用。缺锰的土壤上每亩用硫酸锰2千克拌细干土10～15千克于耕前均匀撒施；或每千克种子用4～10克硫酸锰，少量水溶解后均匀喷于种子表面，晾干后播种。叶面施肥可用禾丰锰2000～3000倍溶液，或0.2%的硫酸锰溶液，分别在棉花蕾期、初花期、盛花期喷施2～3次。试验证明，锰肥拌种对提高种子发芽率有明显的促进作用，并具有防止植株早衰、提高棉花果枝数、增强植株光合效率等作用。但施锰肥过量，易造成棉花植株锰中毒，根一般表现颜色变褐、根尖损伤、新根少，叶片出现褐色斑点，叶缘白化或变成紫色，幼叶卷曲等。可能导致缺乏铁、锌等养分。长江流域锰缺乏或过量均少出现。
