棉籽从轧出到播种需5～6个月的时间。在此期间，如果棉籽堆放、温湿度控制以及人工管理不适当，都会引起棉胚内部游离脂肪酸增多，呼吸旺盛、微生物大量繁殖等问题，导致棉籽发热霉变，丧失生活力。所以在棉籽贮藏期间，应掌握以下技术环节。
(1)棉花种子贮藏前的准备工作
(1)棉花种子贮藏前的准备工作
①棉花种子的准备 首先选择饱满成熟的棉花种子。饱满成熟的棉花种子种皮结构致密而坚硬，外有蜡质可防御外界温、湿度的影响，种皮内含有约7.60%的鞣酸物质，具有一定的抗菌作用，贮藏性好，未成熟的棉花种子不耐贮藏。所以应选择霜前花的棉籽做种用贮藏。其次是剔除破损粒、霉烂粒、病虫粒等不健康的棉花种子。严格控制棉花种子入库指标。棉花种子安全入库标准为：水分<ii26～12%，净度≥99.5%，发芽率>80%。这三项指标中有一项达不到即为不合格棉花种子，不能入库贮藏。
②仓库的准备 首先应对仓库全面检查，确定仓库门窗关闭是否灵活，隔热和密封效果是否完好，监控仓库温、湿度的仪表是否能正常工作等。其次是清仓和消毒，清仓和消毒是防止品种混杂和病虫滋生的基础，清仓不仅将仓内不同品种的棉花种子、杂质、垃圾等全部清除，还要清理仓具、输送管道以及铲除仓外的杂草等，空仓消毒可用敌百虫或敌敌畏等处理。
(2)棉籽堆放用于贮藏棉籽的仓库，仓壁所受侧压力较小，但也不宜堆得过高，一般只可装满仓库容量的50%左右，最多不能超过70%，以便通风换气。棉籽堆装时必须压紧，可采用边装边踏的方法把棉籽压实，以免潮气进入堆内使短绒吸湿回潮。由于短绒具有相当好的保温能力，所以棉籽入库最好在冬季低温阶段冷籽入库，这样可延长低温时间。当堆内温度较高时，则应倒仓或低堆，以利通风散热。袋装棉籽须堆垛成行，行间留走道。如堆放面积较大，应设置通风篱笼。
(3)水分和温度我国地域广大，贮藏方式应因地制宜。华北地区，由于冬、春季温度较低，当棉籽水分在12%以下，可以用露天围囤散装贮藏的方法长期保管。冬季气温过低时，须在外围加一层保护套，以防表面棉籽受冻。当水分在12%～13%时，要注意经常给棉籽测温，以防发热变质。如果水分超过13%，则必须重新晾晒，使水分降低后才能人库。
华中、华南地区，温湿度较高，必须有相应的通风降温设备。安全水分也要求达到11%以下，堆放时不宜压实。在贮藏期间，保持种温不超过15℃。必须将长期贮藏的棉籽水分控制在10%以下。
(4)检查管理
①检查温度 棉籽堆积在仓库中须装置测温设备，方法是每隔3米插竹筒一根，管粗约2厘米。竹筒一端制成圆锥形以利插入堆内，在管内上、中、下各置温度计一支。当水分在11%以下时，每隔5～10天测温一次；当水分在11%～12%时或9～10月贮藏的棉籽，需每天测温一次。棉籽温度须保持在15℃以下，如有异常现象，立即采取翻堆或通风降温等措施处理。
②湿度检查入冬以后，水分在11%以下，每隔5～10天检查1次。12%以下则应每天检查。湿度检查应在仓内的不同方位、不同层次定时定点进行。
③通风 必须根据仓库内外的温度和相对湿度而定。当外界温、湿度均低于仓内时，是通风的最佳时机，此时通风既可降温又可排湿；当仓外温度与仓内温度相同、而仓外湿度低于仓内或仓内外湿度基本相同，或仓外温度低于仓内时，也可以通风，前者以散湿为主，后者以降温为主。
④杀虫棉红铃虫和棉尖象甲是为害贮藏棉籽的主要害虫，它们不但为害棉籽，而且还易引起真菌的繁殖，降低棉籽的质量。如在棉籽入库前发现有虫，可在轧花后进行高温暴晒或将60℃左右的热空气通过种子5分钟，再装袋闷2小时，可将棉红铃虫杀死。如在棉籽入库后发现有虫，可用热气熏蒸棉籽，热熏时，将55～60℃的蒸汽通人种堆约30分钟，整个种堆受热均匀后，检查幼虫已死，即可停止。除了热熏，也可用药剂防治。在仓内沿壁四周堆高线以-Fi~罟lul)~．存艚内格前渠由药鞠1．当~a泵纳出nw人艚内时便可将其杀死，也可用敌百虫、杀螟松和马拉硫磷等拌种。
⑤定期检测 棉花种子贮藏期间要定期检查棉花种子质量，以便及时了解棉花种子的贮藏情况，检测通常包括棉花种子发芽率试验、水分测定、游离脂肪酸测定，如发现问题应及时解决。
⑥防火棉籽的短绒燃点低，而棉籽含油量又高，所以遇到火种很容易燃烧。短绒在开始燃烧时往往不易察觉，一旦被发现时已酿成火灾，应予充分重视。要严禁火种接近棉籽仓库，做到棉籽仓库周围不堆放易燃物品。仓库工作人员不得带打火机、火柴等物入库，更不能在仓库内吸烟。
