棉苗猝倒病在我国棉区均有发生，特别在潮湿多雨地区发生严重，是一种常见的棉苗根病，常造成棉花小苗成片青枯倒伏死亡，对棉花出苗生长影响很大。
(1)发病症状一般先从幼嫩细根侵染，危害幼苗，也能侵害种子及露白的芽，造成种苗出土和发育不良。最初在幼茎基部贴近地面的部分出现水浸状，严重时呈水肿状，并扩展变黄腐烂，呈热水烫状而软化，迅速腐烂倒伏。地下部细根受害则变黄褐色，吸水不良，导致整株幼苗死亡。子叶也随着褪色，呈水浸状软化，在高湿情况下，有时病部出现纯白色浓密絮状物，为病菌的菌丝，能蔓延扩散侵染相邻健康棉株，以致成片棉苗死亡。与立枯病不同的是，猝倒病棉苗茎基部没有褐色凹陷病斑。
(2)发病规律病菌由鞭毛菌亚门真菌瓜果腐霉菌引起。属土壤习居菌，喜欢潮湿，大多牛活在富含有机质、湿度较高的菜园土、大田土、苗床土中。干燥的沙土以及含盐碱的沼泽土中则较少。土壤中所存活的病原菌（卵孢子）是初侵染的主要来源，病菌常借水流传播，高温高湿条件下，病组织表面所长出的病菌是再次侵染源。含水量高的涝洼地及多雨地区，有利于病菌的发育及游动孢子的传播。
若土壤温度低于15℃，萌动的棉籽出苗慢，就容易发病。棉苗出土后，若遇上低温降雨天气，特别是含水量高的低洼地及多雨地区，地温低于20℃，发病就重。棉苗出苗后1个月内是最易感病时期，其他苗病也容易同时发生，使病害加重。
(3)防治方法
①农业防治播前精细整地，降低田间湿度，适期播种，培育壮苗。出苗后破除板结、降低土壤湿度。雨后及时中耕，大雨后应注意排涝，防止土壤含水量过多。
②种子处理 播种前必须精选高质量棉种，经硫酸脱绒，以消灭表面的各种病菌，淘汰小籽、瘪粒、杂粒及虫蛀粒，再进行晒种30～60小时，以提高种子发芽率及发芽势，增强棉苗抗病力。
③药剂防治在播种前用干种子重量0.2%的二氯萘醌拌种，也可用40%三乙膦酸铝可湿性粉剂800倍液喷雾，或用甲霜灵颗粒剂在播种时沟施，或用25%甲霜灵可湿性粉剂3000倍液在苗期灌根。在寒流及阴雨前及时喷药保护，一般在出苗80%左右应进行喷药，以后根据病情决定喷药次数及药剂种类和浓度，常用药剂有0.25%～0.5%等量式波尔多液。
