在稻草、麦秆、废棉及棉籽壳等农作物秸秆中含有大量的纤维素和半纤维素，草菇菌丝可通过分泌纤维素酶和半纤维素酶把它们降解为葡萄糖后加以利用。所以稻草、麦秆、废棉等农作物副产品是栽培草菇的良好碳源。
由于秸秆中纤维素和半纤维素分解转化为葡萄糖的速度较慢，很难及时满足草菇生长发育的需要。所以在利用秸秆作碳源时，最好是先经过处理后再使用。为了促进草菇菌丝的初期生长，可以在这些秸秆的培养料中适当加入一些容易被吸收利用的葡萄糖、蔗糖等。但这种补充碳源的浓度不宜太高，一般在0.5% N2%为宜，过高反而会抑制菌丝生长。
配制培养料时，要注意培养料的碳和氮的比例，实践证明碳氮比为60:1时最适合草菇生长。
